感染是导致尿毒症透析患者死亡的第二位危险因素。慢性肾功能不全尿毒症可以使机体免疫能力受损，抵抗力下降，从而更容易发生感染。比如肾衰竭时，血白细胞出现异常，表现为白细胞吞噬和杀菌能力下降；由于尿毒症毒素作用，机体的细胞和体液免疫功能也会受损，从而外界病原体侵入造成感染。另外尿毒症时易于发生营养不良，也是机体抵抗力下降的重要原因。尿毒症患者的年龄、有无患有糖尿病及有无使用免疫抑制剂等因素也是易发生感染的重要因素。一般情况下，高龄、合并糖尿病及使用免疫制剂药物治疗的患者更容易发生各种感染。
尿毒症时最常见的感染为肺部感染，其次为尿路感染。对于血液透析患者，则动静脉内瘘和静脉置管感染也是重要的感染部位，而对于腹膜透析患者则腹腔感染是比较常见的感染部位，且腹膜反复感染还是腹膜透析患者腹膜丧失功能及退出透析的重要原因。需要注意的是肝炎病毒等血源性传染疾病在血液透析患者间可以相互传播，因此需要加强透析操作的规范，并严格要求各种消毒隔离措施。
因尿毒症毒素作用，尿毒症患者的体温调节中枢可受到抑制，导致患者体温在感染时较正常变化不大，因此不易被发觉。因此对于尿毒症患者不能仅凭体温的变化情况来判断是否存在感染，应根据患者的综合状况进行判断。以便早发现早治疗，以免引起严重并发症。
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